Кефир, а (у), муж. Густой питательный напиток из перебродившего коровьего молока, заквашенного на специальных грибках.
 
В русском языке есть существительные  								мужского рода, которые называют вещество и  								употребляются при обозначении некоторого  								количества этого вещества. Например: стакан 								     кефиру , 								килограмм сахару, литр квасу, чашка чаю,  								пакет крахмалу; положить сахару в чай, нет ни  								кусочка сахару. У большинства таких  								существительных формы с окончаниями -у (-ю) и -а (-я) взаимозаменяемы, то есть  								правомерно сказать как кефира, так и кефиру, тарелка супу и  супа, положить в чай сахару и сахара.
 Как  								правило, если существительное мужского рода,  								называющее вещество, имеет суффикс -ок,  								то употребляется окончание -у: выпить  								чайку, коньячку, подбросить угольку, подложить  								сахарку, подрезать сырку,  купить медку, попить  								кофейку.
А как же  молочко, винцо? Ведь не говорят выпить молочку или выпить винцу?  								Конечно, нет. Но это существительные среднего  								рода, а до этого говорили о мужском.  								Правда, туда же попало и слово кофе (выпить  								кофейку), но слово  								кофе в русском языке мужского рода.
Источники информации:
Дополнительно на Геноне: